自身免疫性腦炎的治療包括幾個方面： 1、免疫治療合并腫瘤的患者要進行切除腫瘤等抗腫瘤治療，對于癲癇發作和精神癥狀等癥狀治療，還包括一般性支持治療以及康復治療等；免疫治療分為一線免疫治療、二線免疫治療和長程免疫治療：一線免疫治療常用的藥物包括糖皮質激素，靜脈注射用的免疫球蛋白和血漿交換；二線免疫治療包括利妥昔單抗，靜脈用的環磷酰胺，主要用于一線免疫治療效果不佳的患者；長程免疫治療藥物，主要包括嗎替麥考酚酸酯、硫唑嘌呤等，主要用于復發病例； 2、針對腫瘤治療，抗NMDA受體腦炎患者一經發現卵巢畸胎瘤，要盡快予以切除，對于未發現腫瘤但是年齡在12歲以上的女性，建議發病以后4年以內，每6-12個月進行一次盆腔超聲檢查；自身免疫性腦炎患者如果合并惡性腫瘤，應由相關的專科進行抗腫瘤治療，在抗腫瘤治療期間，一般需要維持其對自身免疫性腦炎的免疫治療，以一線免疫治療為主； 3、合并癲癇治療，自身免疫性腦炎的癲癇發作，對于抗癲癇藥物反應較差，可選用廣譜抗癲癇藥物，比如苯二氮卓類、丙戊酸鈉、左乙拉西坦等； 4、對精神癥狀的控制，可以選用的藥物包括奧氮平、氯硝西泮、丙戊酸鈉、喹硫平等，需要注意藥物對意識水平的影響，以及錐體外系的不良反應等。免疫治療起效以后要及時減停抗精神病的藥物，具體的治療方案要結合病人的自身情況，做到個體化，以醫生的具體指導為準。