80%自身免疫性腦炎預后良好，自身免疫性腦炎又叫監護室腦炎，在幾十年前是非常嚴重的疾病，在急性期表現的非常兇險。很多自身免疫性腦炎患者可能在急性期不能脫離監護室，甚至有些需要呼吸機輔助，很難控制癲癇的發作、精神癥狀的表現。 有80%的自身免疫性腦炎患者通過早期及時的治療，都可以恢復正常生活，也有很多年輕患者通過治療以后可以較好的生活。