物理治療并非疼痛治療的首選，疼痛后應精確診斷疼痛的病因、病灶，而并非首選物理治療。如果患者不知道病因、病灶，單純使用止痛措施，如物理治療、止痛藥，可能會造成疾病延誤。如出現肚子疼，懷疑為闌尾炎，如果患者不知道病因，單純進行物理治療去止痛，會造成闌尾炎病情加重，甚至闌尾炎穿孔，造成腹膜炎。若患者病因、病灶明確，物理治療的選擇是不錯的方式，因為物理治療對于部分慢性肌肉疼、慢性骨關節疼效果較好。