一般根據胸椎結核椎旁膿腫患者的胸椎核磁共振或者CT來判斷，胸椎結核椎旁膿腫的大致位置，和胸椎椎旁膿腫的多少、大小，來決定胸椎椎旁膿腫的治療方案。一般對于散在的、小的椎旁膿腫，可以抗結核治療，來消除椎旁膿腫。而對于比較大一些的椎旁膿腫，或者比較散在的、大的椎旁膿腫，有時候需要進行手術清除膿腫，包括引流和沖洗，而沖洗液中可以添加抗結核的藥物，來抑制結核菌的繁殖、生長。對于胸椎結核造成椎體的破壞，或者出現了神經受壓的表現，會選擇應用開放手術來徹底清除椎旁膿腫，而固定椎體的穩定性，從而來治療胸椎結核椎旁膿腫。而對于大多數胸椎結核椎旁膿腫，一般都不會造成相應的神經癥狀，大多數可以應用藥物進行保守治療。