胸椎結核的確診主要是在流注膿腫中找到結核分枝桿菌或病理切片診斷。它的病原菌主要是人型結核分枝桿菌，一般不能直接侵入骨或關節的滑膜引起骨與關節結核，主要是繼發于原發性肺結核或胃腸道結核，通過血液傳播所致。 胸椎結核患者病變部位穿刺活檢以及手術后病理組織學是確診的重要方法，病理學檢查見到典型結核性肉芽腫，且通過抗酸染色或其它細菌學檢查，證明為結核分枝桿菌感染是確診的依據。如果依據臨床表現和術中所見考慮為結核，而病理檢查未見到典型的結核性組織改變，涂片或結核菌培養的細菌學證據，同樣可以確立結核診斷。因此在結核病灶清除術中，細菌學標本的提取與送檢是必要的。