女生小便時尿道刺痛有以下幾種原因：1、泌尿系感染：首先要排除有沒有泌尿系感染的可能，因為女生容易出現泌尿系感染，女生尿道偏短且靠近陰道，月經血或性生活分泌物可能會通過尿道逆行感染，引起尿道炎甚至膀胱炎。女生泌尿系感染最常見的癥狀是尿道刺痛，還會有尿頻、尿急、下腹部墜脹、血尿，甚至發燒的癥狀，做尿常規檢查如果提示白細胞明顯增多，就可以診斷為泌尿系感染；2、泌尿系結石：還有些女生有結石，也會出現尿道刺痛，比如輸尿管末段結石刺激膀胱，可能會產生尿頻、尿急、尿痛，結石掉入膀胱進入尿道的時候，可能會引起尿道刺痛。此種情況下，可能會有血尿，通過B超檢查可能發現結石；3、尿道綜合征：有些女生出現尿道刺痛可能與尿道綜合征有關，即不明原因導致尿頻、尿急、尿痛等癥狀。所以，女生出現尿道刺痛，首先要做尿常規檢查判斷是否為感染，再進行相應的檢查，尋找導致尿道刺痛的原因進行治療。