感染性腹瀉一般指進食比較臟的食物，導致細菌感染，使腸道出現炎癥，而后出現腹瀉。可以服用抗生素，如甲硝唑，一方面把外來的致病菌殺滅，可能對腹瀉有控制。但如果服用太多抗生素，可能把腸道大多數的有益菌殺滅，殺滅后致病菌可能會增加，如艱難梭菌，甚至出現偽膜性腸炎，治療非常困難。大多數人服用消炎藥即可緩解，但部分身體抵抗力差的人，如果抗生素服用過多，會出現艱難梭菌感染導致腹瀉，反而加重治療難度。 臨床建議服用相關益生菌制劑，增加有益菌，及時殺滅有害菌。如果腹瀉厲害，可以配合服用易蒙停等，減少腸道分泌，對于疾病的控制更加有效。但不是所有人均可通過服用抗生素治療。