胃旁路手術作為減重手術而言，并發癥發生率很小，甚至比腹腔鏡膽囊切除并發癥發生率更小。該手術從1951年開始實施，已經證明屬于安全有效的手術。但任何手術均存在風險，故應該在大的中心由有經驗的醫生操作，同時選擇好適應證。 手術需將胃切成胃小囊，再將小腸斷掉后遠端接上，重新再接腸子，然后形成胃旁路，接口破裂后容易出現瘺。此外，腸子接完后可能出現不通的情況，即所謂的消化道梗阻。胃旁路術后還可能出現吸收減少、食物攝入減少，導致后期營養不良、營養不良性貧血。但總體而言，并發癥的風險很小，完全可以接受，尤其對于合并病態肥胖、合并2型糖尿病的患者，為非常好的選擇。