微小病變性腎病的病因和發病機制目前不完全清楚，可能和免疫介導的因素有一定關系。微小病變的主要情況就是表現為腎病綜合征，在顯微鏡下往往看不到明確病變，只有在電鏡下面才能看到足細胞的廣泛損害。通常認為病變發生原因和感染性疾病有關，但和感染性疾病沒有因果關系，可能是感染性疾病啟動了體內的免疫因素，導致抗原抗體復合物在腎臟沉積。另外有些抗原也可以直接在腎臟沉積，就有可能激活免疫反應，造成腎臟損傷，然后造成足細胞病變，病人出現腎病綜合征，這是目前大致認為的發病機制。另外，高血壓、糖尿病等也有可能會增加腎小球囊內壓，也有可能造成微小病變的發生，但是目前沒有太多臨床證據證明。所以目前造成微小病變性腎病的原因和機制并不清楚，推測可能與免疫性因素有較大關系，所以會給病人應用激素、免疫抑制劑進行治療。