自閉癥和抑郁癥屬于兩種不同體系的疾病，自閉癥主要是大腦發育異常而引起缺血缺氧，出現神經遞質紊亂從而導致的一系列癥狀，主要表現為言語減少、與他人溝通減少、封閉自己等，可通過相應的康復鍛煉改善癥狀。抑郁癥屬于精神疾病，表現為情緒低落、抑郁、不愿與他人溝通，會有自卑、自閉癥狀，甚至會有自殺傾向，屬于情感功能障礙。自閉癥和抑郁癥引起的癥狀可能存在部分交叉，但自閉患者表現出的不與他人溝通不具有情感色彩，抑郁癥患者表現出的言語減少是由情緒低落引起，與自閉癥自身大腦病變引起的同樣癥狀有所區別。