所謂霉菌性腸炎，其實就是真菌性腸炎，治療辦法有：1、抗真菌藥物：主要是殺滅真菌，主要有抗真菌的藥物。抗真菌的藥物，包括常見的金霉素，稍微少見一些像大扶康，都可以達到抗生菌的作用；2、調節腸道微環境：同時可以用調節腸道微環境，用益生菌去抑制真菌生長；3、支持治療：產生霉菌性腸炎一般是有原因的，見于病情相對比較重、危重的患者或者長期使用抗生素、過量使用抗生素，導致腸道的菌群環境被破壞，從而引起真菌繁殖。像這類病人治療原發病也很重要，比較好的支持治療，讓身體狀態得到恢復，自己產生抵抗力。另外，就是要加強腸道內環境的調整，最后才是抗真菌治療，包括制霉素、大扶康，都可以起到治療霉菌性腸炎的作用。所以對于霉菌性腸炎，抗真菌治療、改善微生態的治療和支持治療都比較重要，能夠幫助治療霉菌性腸炎，并且得到恢復。預防也很重要，病情比較危重時容易出現霉菌性腸炎的改變。