胃腸道間質瘤臨床表現多樣，且缺乏特異性，主要取決于腫瘤的大小和部位，大約有1/3的患者在早期沒有明顯癥狀，常常是在胃腸鏡檢查或者常規體檢時意外發現，腫瘤長到一定大小后，腫瘤壓迫周圍組織和器官，部分患者可能會出現腹痛、腹部不適、消化道出血，及腹部包塊等癥狀。但上述癥狀并非胃腸道間質瘤所特有，很多消化道疾病都有類似癥狀。如果胃腸道間質瘤生長在小腸內，中晚期的患者可能會出現腸梗阻表現，表現出排便困難、腹痛、腹脹，或者突然發作的劇烈腹痛。如果腫瘤長在食管部位，可能會出現吞咽障礙、吞咽不適等癥狀，部分患者還可能會出現急腹癥，比如腫瘤破裂、消化道梗阻或闌尾炎疼痛。需要注意的是，無論胃腸道間質瘤長在什么部位，一旦出現不適，務必要予以重視，盡快到正規醫院就醫檢查，盡早確診、盡早治療。