牙齦上的肉爛個窟窿，說明病癥已經發展到了比較嚴重的階段，常見原因有以下幾種：一、炎癥類疾病：包括牙齦里的或者牙周的膿腫性疾病，或者牙體膿腫性疾病產生的牙齦瘺管，這種炎癥性疾病通常需要做針對性的治療，包括牙體根管治療或者是牙周手術等，牙周治療可以取得比較好的治療效果。二、非炎癥性疾病：1、在臨床上相對來說比較多見的就是牙齦瘤。牙齦瘤是發生在牙齦上的一種牙齦組織增生性疾病，在臨床上伴有感染，或者是對牙槽骨進行破壞吸收后，會產生牙齦潰瘍、糜爛等多種臨床表現；發生在牙齦上的良性或者惡性腫瘤，在臨床上也是出現牙齦的潰爛等多種臨床表現；2、還包括發生在頜骨的囊腫類或者是腫瘤性疾病，對牙槽骨骨膜或者牙齦破壞后，在牙齦上形成瘺管樣的結構。因此在臨床上出現牙齦上的肉爛個窟窿的情況，說明這種病癥發展到比較嚴重的程度。盡快找專科醫生進行診斷和鑒別，制定有效的治療計劃，才能對病癥進行徹底的治療。