膠囊胃鏡本身具有一定的局限性，只能觀察胃以下以及結腸以上這部分腸道的情況。若需進行胃鏡、腸鏡檢查，通常的胃腸鏡檢查比膠囊胃鏡更清晰和準確，具體需根據患者的病情，以及相應的實驗室檢查最終確定。胃腸鏡膠囊鏡在進行胃鏡檢查時較常用，膠囊胃鏡有充足的電力，且患者無明顯禁忌證的情況下，均安全可靠。膠囊胃鏡為科技進步下的一種新型產物，檢查方法為患者將膠囊口服吞下，隨著腸道壁的不斷蠕動，促使膠囊機器人逐漸向腸道下段運動，在整個運動過程中會自行拍攝腸道內的具體情況。若膠囊胃鏡發現相關病變，可根據大致走行位置判斷病變的具體位置，但定位不一定準確，可能給臨床醫生造成一定的困擾。