急性腎功能衰竭主要與慢性腎功能衰竭進行鑒別診斷，通常急性腎功能衰竭特點為起病急，短期內腎功能由正常變為異常；慢性腎功能衰竭通常病史較長，患者存在較長時間的慢性病，腎功能衰竭逐漸形成。同時從腎臟結構可以進行判斷，急性腎功能衰竭患者不存在腎臟體積縮小，但慢性腎功能衰竭會出現腎臟體積縮小。 此外，多數慢性腎功能衰竭患者會出現相應并發癥，如長期腎功能不全會導致腎性貧血發生，還可出現低鈣、高磷、腎性骨病等臨床表現，急性腎衰竭則很少發生。同時急性腎功能衰竭還需根據病因進行鑒別診斷，包括腎前性、腎實質性以及腎后性因素。