黏液表皮樣癌屬于惡性腫瘤，若無包膜或包膜不完整，與周圍組織無明確界限，存在轉移可能，但總體臨床轉移患者較少，因為大多數黏液表皮樣癌都是高分化。若患者屬于低度惡性腫瘤，較少發生淋巴結轉移，遠處血行轉移更少見。 因此大部分患者預后較好。但臨床也存在少部分患者，發現時已經是低分化黏液表皮樣癌，生長較快，經常累及周圍組織，淋巴結轉移率較高，而且存在少部分患者出現血行轉移即遠端轉移或遠處轉移，預后相對較差。 因此黏液表皮樣癌病理分級對生物學行為影響較大，常將此類病理分級作為臨床手術治療參考。低分化黏液表皮樣癌常需給患者進行選擇性頸淋巴清掃術，是預防頸部轉移較重要的方法。