經食道超聲心動圖是將探頭從食道插入到心臟后方，觀察心臟的病變情況，目的是排除肺氣對檢查的干擾，采集的圖像更加清楚，而缺點是切面比較少，能看到的結構比較局限。做該項目一般風險不大，但是對于體質極度虛弱、持續高熱不退、麻醉劑過敏、嚴重心律失常、嚴重心力衰竭、不穩定性心絞痛、急性心肌梗死、血壓高或者是過低的患者、咽部或食道病變如潰瘍、靜脈曲張病癥的患者是禁忌癥。患者在檢查中會有惡心，患者耐受程度不同，不適感輕重也有所不同。檢查后會有咽部不適或者是輕度惡心癥狀，部分患者咽部會有水腫出血，注意要清淡飲食，檢查當天半流質飲食，休息即可，一般不會留下后遺癥。