膽囊結石有多種方法檢查，最常見的有彩超、CT、磁共振等三項檢查，其中最優先的選擇是彩超。彩超對人體沒有傷害，而且對膽囊壁厚薄、膽汁透聲度，以及結石數目、大小、位置都有很好的判斷，也可以為膽囊結石的治療提供更好的方案。 CT對于一部分病人是陰性結果，也就是有的病人做CT沒有發現結石，不等于沒有膽囊結石。磁共振對膽囊結石判斷更重要的優勢在于肝外膽管，肝外膽管若有擴張或者膽總管有結石，處理膽囊結石的同時要處理這部分問題。