內鏡檢查是指通過鏡子進入到體內，也可以是各種腔道內進行觀察和治療。消化科是應用內鏡比較廣泛的科室，因為整個消化道都可以通過內鏡完整看到，不但可以通過內鏡做檢查，還可以進一步做治療。內鏡檢查常見的有以下幾種：1、胃鏡：從口咽部進入到食管，完整地觀察食管、胃，甚至十二指腸球、十二指腸降部；2、結腸鏡：通過肛門進鏡，完整地觀察到整個的結腸，甚至小腸的末端；3、小腸鏡：包括單氣囊、雙氣囊的小腸鏡，經口、經肛做小腸鏡在中間完成對接，可以完整觀察小腸。除了消化科外，其他科室也可以運用內鏡進行檢查，比如關節鏡，通過特殊的器械進入到膝關節、肩關節，進行關節的檢查和治療。