骨髓增生異常綜合征的存活率較難回答，高危的骨髓增生異常綜合征病人若不經積極治療，存活率基本為0。若為高危病人經歷造血干細胞移植，可能達到治愈，骨髓增強抑制強度或存活率總體應可達40%以上，但也取決于疾病分型及治療方案。骨髓增生異常綜合征分為幾個類型，可分難治性貧血，也可分為轉換型。根據不同類型，生存機會不同。難治性貧血伴有異常原始細胞增多，如難治性貧血，病人可能表現為一系，甚至三系全細胞的減少。但此類病人，若為低危情況，輸血依賴不明顯，此病人可長期存活十幾年以上。而對輸血依賴，建議做異基因造血干細胞移植。轉化型趨向于白血病的轉化，需結合其異常的染色體變化，分為高危的骨髓增生異常綜合征，其轉化為白血病的機會基本為100%，一般在3-6個月內轉化。除其分型，還需根據治療反應，新藥治療可否接受有一定關系。如去甲基化藥物，阿扎胞苷或地西他濱，這類病人原來束手無策，僅依賴于輸血。但經過藥物治療，部分病人可能脫離輸血，但總的存活時間無較大的改善。