體外沖擊波碎石也適合輸尿管下段結石。由于骨盆阻擋會影響輸尿管下段結石碎石效果，通常采用俯臥位，通過俯臥位交叉定位，常常可以避開骨盆，可以準確的將輸尿管下段結石通過沖擊波徹底打碎排出。輸尿管下段結石，病人采取俯臥位，水囊在頂起膀胱及輸尿管下段時，可以更精準的定位，沖擊波距離輸尿管較近，通過沖擊波將結石打碎后，多數病人通過大量飲水，通過口服擴張輸尿管的藥物及中成藥物，將結石徹底排出體外。體外沖擊波碎石在治療后一周左右，然后可以復查結石是否打碎排出，體外沖擊波碎石治療后，病人需口服抗生素，預防感染發生。由于結石在排出過程中會導致局部梗阻，引起感染，所以口服抗生素可以預防感染發生，同時口服擴張輸尿管的藥物，如6542或哈樂等，可以促進結石排出體外。