痰檢查到非結核分枝桿菌治療與否需要視情況而定。首先應判斷非結核分枝桿菌是否對人體有致病性，及非結核分枝桿菌是否存在于肺中。只有判定是致病性非結核分枝桿菌才需要治療，絕大部分非結核分枝桿菌即使在痰檢查時發現也不需進行治療。 非結核分枝桿菌是除結核分枝桿菌和麻風分枝桿菌以外的分枝桿菌總稱。非結核分枝桿菌種類較多，廣泛分布在空氣、土壤、水中，絕大部分非結核分枝桿菌對人體沒有致病性，只有小部分結核分枝桿菌對人體存在致病性。