根除幽門螺桿菌后建議停藥4周后再復查，從而才能避免假陰性的結果。臨床上使用四聯療法治療幽門螺桿菌，包括兩種抗生素、質子泵抑制劑、鉍劑。而在用藥過程中可以將絕大多數細菌殺滅，但有時細菌并沒有真正的完全死亡，只是活性下降，所以在短期內復查幽門螺桿菌有可能出現假陰性結果。當停藥4周后，在去除可疑因素的情況下，如果細菌仍然存在，此時進行尿素呼氣試驗則能夠檢出。呼氣試驗能夠較為準確地檢查有無幽門螺桿菌感染，并不推薦使用抽血查抗體的方法，因為即使目前已經不存在幽門螺桿菌感染，但抗體還會在體內存在很長一段時間，所以停藥后抽血查抗體仍然會出現陽性情況，對診療的判斷毫無意義。綜上所述，如果進行幽門螺桿菌治療，建議停藥4周以上復查，復查方法首選尿素呼氣試驗。