幽門螺桿菌在進行標準化治療后，建議停藥1個月，或超過1個月的時間再進行復查，復查方法首選碳-13呼氣法和碳-14呼氣法。如果停藥時間不足1個月，幽門螺桿菌當中的尿素酶很難得到恢復，此時會出現假陰性的結果。所以幽門螺桿菌進行根治后建議停藥1個月，或更長時間進行復查。目前治療幽門螺桿菌感染的方法主要是四聯療法，藥物包括抑制胃酸的藥物、兩種抗生素及鉍劑。抑制胃酸的藥物有質子泵抑制劑，而質子泵抑制劑代表性的藥物是奧美拉唑、雷貝拉唑、蘭索拉唑、艾司奧美拉唑等，在抗生素首選包括阿莫西林在內的方案。進行標準化四聯療法根治后，80%左右的患者可以獲得根治，復查的時間在停藥1個月以上。