月經期間大便時肛門墜痛，常見于以下原因：1、盆腔充血：月經期間盆底充血，直腸在盆底處，直腸、陰道、尿道為鄰近器官，月經期間由于盆腔整體充血，大便的時由于肛門周圍充血，因此會產生墜痛；2、炎癥：比如是否有盆腔炎、直腸炎等疾病。月經期間由于盆腔充血，炎癥容易復發或者加重，此時免疫力比較差，盆腔炎癥或直腸炎癥加重，肛門會產生墜痛；3、子宮內膜異位癥：在子宮直腸窩或者子宮直腸之間的盆底組織，有子宮內膜異位病灶，臨床稱深部子宮內膜異位病灶，介于直腸和陰道間，經期時由于子宮內膜異位病灶有出血、充血、炎癥，使得肛門墜痛。