甲狀腺疾病通常需要低碘飲食，比如甲狀腺功能亢進患者，應避免含碘較多的食物攝入，包括海帶、紫菜、海蝦、海貝殼等。甲狀腺功能減退大部分是由于慢性淋巴細胞性甲狀腺炎所致，對于慢性淋巴細胞性甲狀腺炎，也就是橋本氏甲狀腺炎，也要低碘飲食。 也有少數缺碘性的甲狀腺病，但是近年我國食鹽加碘以后，缺碘性的甲狀腺病則較為少見。 通常的甲狀腺疾病均屬于自身免疫性甲狀腺疾病，有研究證實，多吃含硒豐富的食物可以抑制自身免疫反應及抗氧化應激反應，所以鼓勵甲狀腺功能亢進或者甲狀腺炎的患者吃富含硒的食物，比如富硒米、富硒雞蛋等。