膽腸吻合需要將生病或受損的膽管完整切除，膽囊也要同時切除，然后取一段小腸，把小腸打斷，一端和膽管的斷端進行端側吻合。可以通過可吸收的縫線，將膽管和小腸進行吻合，形成吻合口，這樣膽汁就可以流到腸內。而腸子的斷端和另外的腸子再進行腸腸吻合，這樣可保證腸道的完整性，還可以防止腸道內的內容物出現膽汁反流。膽腸吻合術是膽道外科比較常用的一種手術方式，正常的膽道進入到十二指腸，而膽腸吻合是將膽管和腸道進行重建。其主要適用的疾病是膽道的腫瘤性疾病，或是膽道損傷膽管無法進行對端吻合，或是胰腺、十二指腸的疾病，需要聯合膽道切除之后，再進行膽腸吻合。膽腸吻合的目的是將肝臟內的膽汁，通過膽腸吻合口，重新進入到腸道。