大多數經期頭痛是偏頭痛，患者可以選擇治療偏頭痛的藥物治療。藥物有好幾種，大多有一定副作用，還是需要醫生幫助選擇。另外女性經期激素水平會出現波動，跟頭痛的誘發有較大關系。有些患者是月經后期疼，有些患者是月經初期疼，所以患者在選擇止痛藥物時要選擇治療時間，并不是吃得越早越好或越多越好，而應該選擇正常時間，要預測頭痛的發作時間，提前1天尋求治療方法，如針刺、放松療法、按摩或者適當體育鍛煉，對有些輕度頭疼可以起到預防的作用。 治療偏頭痛的藥物有預防復發和疼痛發作后緩解疼痛兩類，預防疼痛的藥物有降壓藥、β受體阻滯劑，既有降壓的作用，同時也有預防偏頭痛發作的作用。如果經期頭痛每次都是在月經初期或月經后期，很容易預測發作時間，提前服用上述藥物，就可以起到預防的作用。如果沒有預防好，疼痛比較厲害，可以選擇非甾體抗炎藥，就是常見的退熱鎮痛藥；如果比較嚴重的、頑固的頭痛就要選擇曲普坦類的特殊的偏頭痛緩解藥物。