前列腺肛門指診會有一些脹痛的感覺，具體疼痛的程度根據每個患者疼痛耐受的閾值不盡相同，往往患者會主要描述手指進入肛門時的脹痛感。對于某些前列腺炎的患者，醫生在用手指觸摸腫大前列腺時，也會感覺到非常明顯的疼痛。盡管有些疼痛，但對于診斷前列腺炎、前列腺增生和前列腺腫瘤都有非常重要的臨床意義。在指診時如果摸到一個腫脹、發熱的前列腺，一般這是急性前列腺炎，不能做前列腺的按摩。但如果是一般性的前列腺炎，在做按壓、取液時明確的感到某個葉明顯的腫脹，輕輕按壓患者疼痛就較重，往往是提示著這個部位有前列腺炎。前列腺增生時往往會摸到一個整體都增大的前列腺，但是它的質感是韌的，就像用手指摸鼻尖一樣的感覺。但如果在做指診時發現了一個小硬結，硬的就像用手指觸碰額頭一樣，可能有前列腺癌的風險。