胃腸間質瘤治療方法，需要根據具體情況而定。胃腸間質瘤分不同危險程度，分為極低危、低危、中危和高危。其中有個因素是瘤體大小，一般若瘤體較小，＜2cm可以暫時觀察；若瘤體＞2cm，是以手術治療為主。手術切除胃腸間質瘤，無論是生長在胃上，還是生長在腸道上或腹腔其他部位，完整將胃腸間質瘤切除，為較有效治療方法。除此之外，藥物治療針對胃腸間質瘤的特效藥，為甲磺酸伊馬替尼。現在有更多用藥，類似這類藥均可以針對胃腸間質瘤進行治療。所以如何治療需要根據具體而定，要找專科醫生，根據情況進行針對性的有效且規范治療。