腎臟畸形絕大多數(shù)是在胚胎時期，即在母體中就已經(jīng)形成，其具體形成的原因與內(nèi)環(huán)境、外環(huán)境都有關(guān)系。腎臟畸形與整個機(jī)體遺傳數(shù)值，比如DNA、突變有關(guān)系。也可能跟外界環(huán)境，比如母體存在病毒感染等疾病有關(guān)系。所以，腎臟畸形的原因究竟是自身在生長發(fā)育過程當(dāng)中，信號、通路發(fā)生了異常，還是因為母體發(fā)生了某些疾病的狀況，在這些內(nèi)外環(huán)境或者內(nèi)在的自身原因的影響下，整個泌尿生殖系統(tǒng)都有可能會發(fā)生畸形。除此之外，腎臟病毒感染，或者自身胚胎發(fā)育過程當(dāng)中發(fā)生突變等情況的時候，就有可能會導(dǎo)致腎臟的形態(tài)、位置、結(jié)構(gòu)，發(fā)生與正常情況不一樣的情況，比如馬蹄腎、腎與輸尿管連接部畸形等。