噬血細胞綜合征治療費用與疾病嚴重程度、原發病有直接相關性。早期噬血細胞綜合征經過積極治療很快達到康復，費用較低。部分噬血細胞綜合征患者起病急，需要ICU搶救，一天費用高達2-4萬元。 普通噬血細胞綜合征早期治療應準備5-10萬元以上，難治性復發的患者前期治療需20-30萬元，后期異基因造血干細胞移植40-50萬元，總體費用100萬元左右。