病毒性腦炎和其它如細菌感染是類似的，可以通過腦神經進行傳播。腦內有腦神經，腦神經有出來的運動神經和進去的感覺神經，病毒可以沿著神經侵入到腦內。最常見的是三叉神經第一支被帶狀皰疹病毒侵犯，這時因為三叉神經第一支、第二支、第三支都和顱內相通，病毒可以沿著三叉神經進入到腦內，繼而會發生腦內病毒感染，可以侵犯到腦膜和腦實質，以上即是感染途徑。 治療是抗病毒治療，無論是治療皮膚病毒感染，還是腦內病毒感染，治療方法都一樣，另外腦內感染還應該對癥治療，比如降顱壓。