腦干腫瘤手術的成功率會在手術前通過臨床癥狀學、影像學等預估，通過腫瘤難易程度、手術中的困難、術后可能會引起的并發癥、并發癥是否會改變生活質量、患者是否接受并發癥等預判，在手術前預判并發癥，術后或多或少會出現預判的并發癥，是不可避免，醫患之間應有效溝通。較多患者的良性腫瘤可通過功能影像、術中神經電生理的監測等顯微外科得到較好的預后。