胃腸道間質瘤預期生存時間存在個體差異，與其惡性程度、生長部位、治療方法、治療效果有關。具體情況如下： 1、出現遠處轉移、復發傾向：如淋巴結轉移、肺轉移、肝轉移者，即使腫瘤直徑較小，治療效果仍然較差； 2、發生部位：腫瘤發生在胃、食道者，治療效果較好，10年生存率能夠達到70%以上；腫瘤發生在小腸部位，治療效果較差，10年生存率僅為17%左右。