陰莖下面疼痛的常見原因包括以下幾種：1、尿道炎：最為常見，病人發生急性淋菌性尿道炎時會在尿道黏膜表面形成紅腫、糜爛，導致黏膜破損，出現尿道刺痛、刺癢及尿道口膿性分泌物癥狀；2、包皮系帶撕裂：由于系帶較短，在性生活時或日常勃起后出現系帶撕裂癥狀，病人會出現陰莖下面疼痛癥狀；3、輸尿管下段結石：病人發生輸尿管下段結石時也會引起陰莖放散性疼痛癥狀，出現陰莖下面疼痛癥狀。病人出現上述癥狀時應及時到泌尿外科或男科就醫，通過泌尿系彩超檢查可以除外有無輸尿管結石以及前列腺炎，病人有膿性分泌物時可以通過分泌物檢查明確有無淋菌感染，如有淋球菌感染，應當規范進行藥物治療。