食管癌超聲內鏡適用于局限在黏膜和黏膜下層的早期腫瘤，以及未合并淋巴結轉移的患者，即通過CT檢測，未發現縱隔、腹腔及頸部鎖骨上淋巴結轉移者。超聲內鏡可用來觀察有無黏膜下淋巴結轉移及判斷腫瘤能否切除完整，術前做超聲內鏡可對食管癌進行較為正確的判斷。較早期食管癌可以選擇超聲內鏡治療，切除病變，腫瘤一旦超過黏膜下層甚至肌層，不推薦患者選擇超聲內鏡，建議胃鏡檢查并活檢，選擇外科治療。