室間隔缺損的自愈率，要看室間隔缺損的大小，目前超聲未能給出相關的參考值。室間隔缺損首先要排除染色體異常的問題，以及家族中是否有先天性心臟病發病的背景因素和病史。因此，早期葉酸的補充，還有糖尿病的管理、肥胖的管理、煙酒的戒除，都會在某種程度上降低室間隔缺損的發生率，但是并不是通過上述方法，能完全規避室間隔缺損。如果室間隔發生在肌部，和膜部比起來缺口比較小，自愈的比例就會偏高。