任何手術均有一定的風險性，精索靜脈曲張手術也不例外。臨床上常見的風險有出血、疼痛、復發、睪丸萎縮、陰囊水腫等。顯微鏡下精索靜脈結扎術是目前治療精索靜脈曲張的首選方式，由于術中能清晰分辨睪丸動脈、精索內靜脈、淋巴管、輸精管等結構，精確結扎精索內靜脈，不損傷周圍組織，手術風險的發生率相對較低；傳統高位結扎術的手術視野較局限，容易損傷淋巴管或小動脈，容易造成術后并發癥的出現；腹腔鏡手術切口小，創傷相對較小，但容易造成二氧化碳的蓄積。