結腸間質瘤歸屬于消化道間葉性腫瘤中的胃腸道間質瘤的范疇，間質瘤是一種有潛在惡性傾向的侵襲性腫瘤。會根據腫瘤部位、腫瘤大小、核分裂象計數來區分危險性，如來源于結腸的間質瘤，如果腫瘤比較小，比如不超過2cm，核分裂象計數每50個高倍視野不超過5個，可以判斷為腫瘤的危險度極低，生長特征近似于良性腫瘤的表現。而腫瘤越大或者核分裂象計數越高，結腸間質瘤的危險度也會逐漸的增加，會出現像惡性腫瘤的特征，容易造成復發和遠處的轉移。如果出現在病程的過程當中，或者由于手術操作過程當中發生腫瘤的破裂，則不管腫瘤的大小、核分裂象計數多少，都具備高危險的因素，腫瘤發生播散、種植的可能性就非常高。