胃腸道間質瘤危險度分級有極低危、低危、中危和高危之分，是指胃腸道間質瘤的復發風險分級。胃腸道間質瘤有良性和惡性之分。從生物學行為來說，如果是極低危險度，以后沒有出現復發，考慮是良性。但是在極低危險度的患者中也有復發病例出現，因此腫瘤是良性還是惡性主要根據生物學行為區分。一旦有復發，肯定考慮是惡性腫瘤。 其它疾病，如纖維韌帶樣瘤，多認為是良性，它不會侵襲性生長，但是手術以后容易復發。因此有些極低危險度的間質瘤雖考慮是良性行為，但是也有可能發生生物學行為不好的情況，而使患者出現復發。