先天性心臟病目前一線的檢查方法是超聲心動圖，無論是哪一種先天性心臟病，在門診檢查的過程中，超聲心動圖都是臨床醫生首選的檢查方法，能夠確診出絕大多數的先天性心臟病，而永存動脈干病人在接受超聲心動圖檢查的時候，可以清晰的顯像，發現有一根原始的動脈干直接在心臟上方，同時接受左心室和右心室的血流。同時這一根原始的動脈干又發出升主動脈，發出一系列的頭臂動脈和主動脈的分支，在原始動脈肝的底部又同時發出了左右肺動脈，那這樣子就形成了永存動脈干非常典型的超聲心動圖的圖像。這些病人在動脈干下方往往還存在大型的室間隔缺損，可以看到左心室的血流通過室間隔缺損左向右分流進入右心室。同時有一些病人可能還會合并房間隔缺損，包括動脈導管未閉，或者是主動脈弓狹窄、主動脈弓中斷等一系列的疾病。這些病人還可以通過X光檢查，或者是其它的影像學檢查。來看一下心臟和肺臟的大體的表現，往往在X線檢查的過程中可以看到肺臟充血是非常明顯的，這也符合病人的肺動脈高壓表現。一些大年齡的永存動脈干病人，需要對他實施心導管檢查，來評估病人的左右心室的壓力，動脈干和肺動脈系統的壓力，并測定病人的肺動脈阻力。這個對手術是非常關鍵的信息，如果有一些病人已經出現了艾森曼格綜合征，或者是肺動脈阻力非常高，超出了手術適應癥的標準，這些病人往往就沒有手術機會了。所以這一些手術應該來說需要在病人低年齡的過程中配合臨床醫生的檢查，配合各種輔助檢查，才能夠得出一個確切的手術適應癥。