急性播散性腦脊髓炎的后遺癥多種多樣，一般要根據臨床前期的癥狀來確定，最常見的有癲癇、認知功能障礙、癱瘓、大小便功能障礙等。此病特點就是發病病灶會比較多，可能位于腦、脊髓，可能是大片損害或者小片損害。大部分患者出現腦大片損害時，會有意識障礙。當出現腦干或者小腦損害時，會有頭暈、嘔吐等不適。同時也可能會出現脊髓損害，而引起四肢癱瘓、大小便喪失。這些癥狀若及早治療，可以得到部分恢復，部分甚至可以完全恢復。但部分患者如果治療效果不佳，或者治療不及時，就會出現后遺癥，后遺癥通常就是損害對應出現的癥狀。如脊髓損害恢復最慢的癥狀，常是最早出現的癥狀，部分患者以頭痛起病，后面可能會遺留頭痛等不適。若以大小便功能障礙起病，后面可能會遺留大小便功能障礙的問題。部分患者也可能會有癲癇等后遺癥，但比例相對較少，需要重視肢體癱瘓、大小便功能障礙、頭痛、頭昏，以及偏癱等問題。