新生兒呼吸窘迫綜合征在早期表現為原發疾病相關的一些臨床表現，比如由嚴重感染引起，患兒主要表現為發熱、感染、中毒的癥狀。由于膿毒性休克所引起，患兒可能早期主要表現為循環功能衰竭的相關臨床表現。早期患兒沒有肺功能不全的相應的臨床表現，隨著病情的進展，可能在原發病的基礎上出現病情的急劇惡化，表現為煩躁不安、進行性呼吸窘迫、發紺、呻吟、呼吸困難以及難治性低氧血癥，肺部聽診可能聽到干性啰音或者濕性啰音。隨著缺氧進一步加重，可能會引起肺外的相關系統的表現，如腦缺氧可能會引起意識障礙改變，甚至引起抽搐、驚厥，心臟循環缺氧可能引起心率增快等相應的循環系統表現。