急性發作的結膜炎通常會合并眼表的分泌物，結膜炎的基本特征包括充血以及分泌物。病毒性結膜炎的分泌物具有自身特征，為水樣的分泌物，即質地較稀、像淚水一樣，此類病人從外觀上看總是淚汪汪的樣子，但并非淚道的問題，主要還是因為有水樣的分泌物，也是區別于其他類型結膜炎的特征。細菌性結膜炎的分泌物，通常相對比較黏稠、成型，可以呈團狀，可表現為黃色、白色，甚至黃綠色。如果有病毒性結膜炎，同時又合并細菌感染，可表現出既有水樣分泌物，也有成型的分泌物。對于過敏性的結膜炎，可表現為眼部有透明、黏稠、拉絲狀的分泌物。對于分泌物可進行病原學的檢測以及細胞學的檢測，如結膜的刮片，在顯微鏡下染色，明確細胞構成，來分辨為過敏性還是其他病原感染性，以及是病毒還是細菌的可能性大，以提供病原學的證據。也可以采用其他方法檢測病原的來源，但需具有更好的檢測條件，此外還存在假陰性、假陽性的問題。對于病毒性結膜炎的治療，需針對病毒，進行抗病毒治療。