如果人們睡覺時肚子疼，醫學稱為睡眠時腹痛，可能原因主要包括以下幾種：一、生理性原因：1、受涼：可能為人們睡眠時受涼，部分人們腸管較敏感、易激惹，受涼時腸管感受到低溫，可能會出現腸管收縮引起腹痛癥狀；2、膀胱儲尿較多：可能人們睡眠時憋尿，如果膀胱內積存大量尿液，可能也會引起腹痛癥狀。二、病理性原因：1、自主神經功能紊亂：可能為腸管或者腹腔內病變，人們平時沒有睡眠時由于注意力被轉移，比如工作或者做其他事情時，注意力沒有關注到病變部位，但睡眠時可能注意力會關注到病變部位，會出現腹痛癥狀。可能為功能性疾病稱為自主神經功能紊亂，一般會引起腸功能紊亂，人們會出現腹脹、間歇性腹痛癥狀；2、腸道器質性疾病：可能原因為腸道存在炎癥、腫瘤，常見比如小腸克羅恩病、腸結核，其他非特異性腸炎、結腸腫瘤、炎癥等情況，均可能會引起患者出現腹痛癥狀。