下腸鏡需要通過肛門，從直腸、乙狀結腸、降結腸、橫結腸、升結腸一直觀察到回腸，檢查過程中需要不停打氣，鏡子反復進出，病人會感到腹脹，甚至部分病人疼痛難忍，故下腸鏡一般較痛，還會有不適感。如果在手法比較熟練內鏡醫師操作下，不適感覺能夠明顯減輕。腸鏡檢查臨床已經越來越普及，在消化內科對于疾病的診療很有好處。 腸鏡檢查最常用于下消化道出血，是必須檢查的項目，如果下消化道造影懷疑下消化道有病變不能定性時，也需要做檢查。如果臨床有下消化道的表現，包括腹瀉、便秘、大便性狀的異常，建議做腸鏡檢查，還可以在腸鏡下做活檢，做內鏡息肉治療甚至放支架治療。