通常飲用咖啡不會導致大便發黑，但可能飲用咖啡較多時會存在咖啡漬使大便顏色變深。導致大便顏色發黑可能與攝入食物，或含有血的成分與胃酸相互反應出現二價鐵，從而使大便顏色發黑。盡管咖啡存在深咖啡色的色素，但經過胃液及消化液作用后，不會使大便顏色發黑。因此，若患者大便顏色黑亮，建議到醫院進行大便潛血檢測，若潛血為陰性則無需過于擔心。通常大便顏色加深，懷疑存在上消化道出血且與胃液發生反應所致。