食管癌支架置入術后可能會出現相應并發癥，最常見的是胸口后疼痛，或者不舒適感，原因可能是出血、食管支架移位，比如支架掉到胃內。部分病人放支架以后會引起反流性食管炎。因此要根據食管癌的部位放置支架，如食管上段癌放支架時，有經驗的醫生不會將支架放置于會厭上段，防止病人出現吞咽困難、咽喉部不適。 食管下段癌靠近賁門，有經驗的醫生會注意放防反流支架，防止放入支架后反流性食管炎的發生。所以有經驗的消化科醫生會多方面考慮病人的情況，放置合適的支架。