食管癌術后最常見的并發癥為吻合口瘺，食管癌手術將癌變病灶切除后，胃與正常的食管相接，接頭處為吻合口。吻合口處可用器械打或手工線縫，可出現一、兩毫米到兩厘米左右的瘺，主要引流、抗感染、加強營養等保守治療，95%以上吻合口瘺可愈合。食管癌術后可出現吻合口狹窄，通過擴張可讓吻合口擴大。還可出現心律失常、肺上感染、乳糜胸、傷口感染等并發癥。